La congelación o criopreservación de una muestra de semen o de biopsia de testículo, es una técnica relativamente sencilla en la que se añadirá a la muestra medio crioprotector y se congelará con vapores de nitrógeno líquido (-196 ºC). Este proceso se realiza según diversas indicaciones:

Casos de oligoastenoteratospermia severa (bajo número de espermatozoides y/o con poca movilidad y/o mala morfología) o periodos de ausencia de espermatozoides en el eyaculado con el fin de disponer de un número suficiente de espermatozoides móviles en el momento de su uso.

En patologías uroandrológicas que impliquen dificultades en el coito (malformaciones, impotencia, etc.).

Almacenamiento de eyaculados previos a algún tratamiento que pueda comprometer la fertilidad en el futuro: vasectomía, tratamientos oncológicos (quimio o radioterapia), etc.

Que exista dificultad en la obtención de una muestra de eyaculado.

Las muestras procedentes de biopsia testicular, pueden ser usadas en fresco y congelar el sobrante para evitar al varón una nueva biopsia si fuera necesario otro tratamiento, o directamente pueden ser criopreservadas y descongeladas el día de su uso.

El número de muestras necesarias para asegurar un número suficiente de espermatozoides el día de la descongelación, variará en función de la calidad de cada una de ellas y del tratamiento indicado.

Los embriones viables de un ciclo de FIV que sean transferidos al útero, podrán congelarse para su uso posterior. Los posibles destinos de los embriones congelados están especificados en la ley 14/2006 sobre técnicas de reproducción asistida. Los embriones podrán utilizarse durante todo el periodo reproductivo de la mujer
.